More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1245 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 438 aa  879    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  57.54 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  53.37 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  50.79 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  48.15 
 
 		 320 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  52.91 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  52.3 
 
 		 305 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  54.49 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  44.44 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  50.3 
 
 		 727 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  35.65 
 
 		 331 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  49.43 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  52.98 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  47.46 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  46.24 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  46.24 
 
 		 327 aa  160  6e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  49.46 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 456 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 		 456 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  48.11 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  46.99 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  47.75 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.98 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 657 aa  156  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  46.51 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  45.95 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  47.51 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  44.09 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  46.37 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  43.94 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  43.24 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  41.86 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  41.36 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  45.2 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  39.77 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  45.95 
 
 		 424 aa  143  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  39.91 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  39.91 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  40.53 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  41.94 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  39.74 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  39.74 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  39.74 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  39.74 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  39.74 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  36.9 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.72 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  36.26 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  40 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  40.46 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  40.46 
 
 		 350 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  35.09 
 
 		 313 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  40.89 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.99 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  35.11 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  36.87 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  40 
 
 		 315 aa  124  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  37.26 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  35.9 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  37.74 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  38.33 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.65 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  36.07 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.15 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  38.69 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.21 
 
 		 328 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.54 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  33.62 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  36.42 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.88 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  35.93 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.84 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.3 
 
 		 362 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.9 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.11 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 		 662 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  34.78 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  34.3 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  34.3 
 
 		 321 aa  93.6  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>