More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0930 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 371 aa  729    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  50.41 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.07 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  40.44 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.52 
 
 		 412 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.89 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.11 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.74 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.11 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  34.52 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.91 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  37.06 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  34.78 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.74 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.68 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  34.08 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.44 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.93 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  33.87 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  34.94 
 
 		 370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  33.87 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.36 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.66 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  34.13 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  36.27 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  32.79 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  33.77 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  38.54 
 
 		 371 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.31 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  33.77 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  32.78 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  34.95 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  37.68 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.18 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.38 
 
 		 370 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  40.33 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  40.14 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.89 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  37.85 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.15 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  37.85 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  37.33 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  33.1 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.33 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  29.64 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.29 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.54 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  37.24 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  34.13 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.46 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  39.01 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.3 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>