45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0902 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  74.55 
 
 		 228 aa  340  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  39.08 
 
 		 535 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  39.08 
 
 		 535 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  33.94 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  40.86 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  26.71 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  32.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  24.34 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  29.1 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  41.57 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  26.67 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  30.3 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  34.48 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  37.38 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  36.47 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  31.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  34.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  33.65 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  35.48 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  37.68 
 
 		 101 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  44.78 
 
 		 172 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  31.87 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  31.76 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  27.37 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  29.92 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  36.05 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  46.03 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  34.48 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  24.52 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  35.71 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  45.1 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  25.54 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  30.69 
 
 		 313 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  43.14 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  29.21 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  30.61 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  24.18 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  32.63 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  26.38 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  36.36 
 
 		 180 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>