182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0894 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  100 
 
 
627 aa  1270    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  87.56 
 
 
630 aa  1111    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  33.91 
 
 
823 aa  316  7e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  34.2 
 
 
669 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  34.2 
 
 
669 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  34.2 
 
 
673 aa  309  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 
663 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  34 
 
 
670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  34 
 
 
667 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
666 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
668 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
664 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  33.07 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
675 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  30.85 
 
 
723 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
664 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
665 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
666 aa  300  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 
665 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
663 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 
672 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  33.14 
 
 
666 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 
669 aa  296  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
662 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  33.4 
 
 
678 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  33.39 
 
 
634 aa  293  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 
674 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  32.28 
 
 
676 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
659 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  34.27 
 
 
637 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  32.6 
 
 
662 aa  291  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  34.27 
 
 
637 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  33.2 
 
 
661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  33 
 
 
659 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 
661 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  32.4 
 
 
661 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  32.87 
 
 
661 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  32.53 
 
 
661 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  33 
 
 
664 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  32.8 
 
 
662 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  32.13 
 
 
661 aa  287  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  31.49 
 
 
687 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  32.41 
 
 
660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  32.2 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  32.73 
 
 
687 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  33.07 
 
 
573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  32.09 
 
 
666 aa  283  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  31.8 
 
 
665 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  32 
 
 
661 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  32.8 
 
 
663 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  32.8 
 
 
663 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  29.59 
 
 
756 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  33.14 
 
 
666 aa  279  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  31.7 
 
 
660 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  33.4 
 
 
661 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  34.94 
 
 
670 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  32.08 
 
 
660 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  31.18 
 
 
700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  31.13 
 
 
626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  32.36 
 
 
644 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  30.7 
 
 
645 aa  263  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  34.25 
 
 
834 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  34.46 
 
 
809 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  34.11 
 
 
828 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  31.38 
 
 
648 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  27.74 
 
 
723 aa  202  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  29.36 
 
 
670 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5160  TRAG family protein  28.35 
 
 
638 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  30.94 
 
 
713 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  27.74 
 
 
714 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  26.78 
 
 
658 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  27.65 
 
 
648 aa  196  7e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  28.85 
 
 
651 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  27.56 
 
 
559 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  31.78 
 
 
531 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  28.66 
 
 
570 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  28.66 
 
 
570 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  28.51 
 
 
548 aa  190  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  25.89 
 
 
641 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  26.82 
 
 
677 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  28.51 
 
 
557 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  27.62 
 
 
560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  29.63 
 
 
758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  26.64 
 
 
554 aa  183  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  27.91 
 
 
561 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  26.64 
 
 
663 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  28.39 
 
 
576 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  28.57 
 
 
575 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  26.41 
 
 
603 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  27.98 
 
 
583 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  27.35 
 
 
594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.97 
 
 
593 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  27.48 
 
 
699 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  29.18 
 
 
678 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  29.83 
 
 
695 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  29.4 
 
 
585 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  29.64 
 
 
628 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  29.74 
 
 
699 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>