More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0811 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  212  2e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1772  thioredoxin  53.33 
 
 
105 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.34775e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  49 
 
 
104 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  46.08 
 
 
120 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  40.86 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  41.41 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.69 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.08 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  41.9 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.24 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  40.2 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  45.19 
 
 
109 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  41.9 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  39.05 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  43.4 
 
 
107 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  45.16 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  45.16 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  40.95 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  40.95 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.36523e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  38 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.15955e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.05 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.71604e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  43.48 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.05 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.68 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  42.72 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  4.49088e-15 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  44.68 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  41.41 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  40.95 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  41.3 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.01 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  43.01 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  41.76 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  40.59 
 
 
105 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  44.55 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  41.94 
 
 
107 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  47.31 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  45.56 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  41.41 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  40.86 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.62 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  44.23 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  37.86 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  41.3 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  41.49 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  43.01 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  51.9 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  38.1 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.94 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.76713e-08  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  46.51 
 
 
104 aa  87.4  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  55 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  39.36 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  38.83 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  43.01 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.22 
 
 
119 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.86 
 
 
107 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.84 
 
 
104 aa  87  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  42.39 
 
 
116 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.86 
 
 
107 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  51.16 
 
 
104 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  40.22 
 
 
106 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  51.16 
 
 
104 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.58 
 
 
107 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  37.14 
 
 
108 aa  87  8e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.81 
 
 
109 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  40.43 
 
 
110 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  44.86 
 
 
106 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  41.94 
 
 
106 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.94 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  41.94 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  43.56 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  37.25 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  41.94 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  48.15 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  44.83 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  40.45 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  44.33 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  9.42681e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  49.41 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.24157e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>