221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0769 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2315  ribosome-binding factor A  62.83 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  33.91 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2557  ribosome-binding factor A  31.75 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.108447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  35.92 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  34.62 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  34.95 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1498  ribosome-binding factor A  36.05 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 141 aa  57  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  29.7 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  27.19 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  29.51 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  26.27 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  32.29 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  27.62 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  27.05 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  28.46 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  24.11 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  28.97 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  30.19 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  24.76 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1691  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  30.19 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  26.42 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  25.98 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  27.47 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>