More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0725 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  100 
 
 
484 aa  961    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  60.37 
 
 
450 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  43.94 
 
 
445 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  43.71 
 
 
445 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  39.13 
 
 
449 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.14 
 
 
482 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  35.96 
 
 
442 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.53 
 
 
461 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.53 
 
 
461 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  38.34 
 
 
444 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.92 
 
 
461 aa  256  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.13 
 
 
460 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  32.28 
 
 
542 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.9 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  34.05 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.97 
 
 
451 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  35.93 
 
 
471 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  30.02 
 
 
480 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  35.31 
 
 
471 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.78 
 
 
473 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  29.82 
 
 
480 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  35.75 
 
 
450 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.19 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.03 
 
 
473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.94 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  32.55 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  30.66 
 
 
480 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  29.08 
 
 
480 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  33.69 
 
 
467 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  31.19 
 
 
479 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  31 
 
 
482 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  31 
 
 
482 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  31.15 
 
 
453 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  31.15 
 
 
479 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  30.06 
 
 
480 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  35.08 
 
 
455 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  38.31 
 
 
454 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  34.42 
 
 
454 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  34.86 
 
 
470 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.55 
 
 
462 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  35.85 
 
 
456 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  30.23 
 
 
465 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.23 
 
 
476 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  30.02 
 
 
480 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.75 
 
 
454 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  34.34 
 
 
453 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.75 
 
 
454 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  31.9 
 
 
450 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  38.03 
 
 
454 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  29.02 
 
 
480 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  29.02 
 
 
480 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  38.03 
 
 
454 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.75 
 
 
454 aa  226  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  37.75 
 
 
454 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.5 
 
 
454 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  29.98 
 
 
443 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  29.71 
 
 
480 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  33.55 
 
 
473 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  34.5 
 
 
473 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.5 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  29.63 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  29.49 
 
 
491 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  29.49 
 
 
491 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  29.49 
 
 
491 aa  223  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  35.01 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  30.82 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  34.03 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  31.19 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  32.31 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  31.67 
 
 
450 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  33.85 
 
 
454 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  31.65 
 
 
456 aa  219  6e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  30.63 
 
 
456 aa  219  7e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  34.07 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  30.09 
 
 
477 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  34.11 
 
 
455 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  33.33 
 
 
442 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  35.13 
 
 
422 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  31 
 
 
485 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.34 
 
 
454 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  30.48 
 
 
466 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  35.59 
 
 
454 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  36.5 
 
 
450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  34.34 
 
 
461 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  33.5 
 
 
470 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.88 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  29.9 
 
 
462 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  29.84 
 
 
480 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  29.65 
 
 
456 aa  216  9e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  29.96 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  32.48 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.67 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.25 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  34.43 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  29.9 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  29.81 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  32.49 
 
 
452 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  35.59 
 
 
463 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  33.79 
 
 
454 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  32.21 
 
 
449 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>