More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0615 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  726    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  76.26 
 
 		 359 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  57.98 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  59.78 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.3 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  58.76 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 355 aa  401  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 367 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.73 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  58.38 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>