More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0597 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 665 aa  1346    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  58.6 
 
 		 676 aa  753    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.01 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.39 
 
 		 648 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.53 
 
 		 751 aa  364  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 646 aa  359  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.85 
 
 		 662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  35.75 
 
 		 642 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 		 618 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 		 704 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.96 
 
 		 642 aa  350  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 		 656 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 667 aa  346  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 761 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.18 
 
 		 643 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.4 
 
 		 806 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.79 
 
 		 679 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.9 
 
 		 643 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.9 
 
 		 643 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.21 
 
 		 638 aa  340  5.9999999999999996e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 		 693 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.57 
 
 		 727 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.5 
 
 		 707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 		 701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 		 681 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  33.8 
 
 		 687 aa  337  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.93 
 
 		 649 aa  337  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.41 
 
 		 625 aa  336  7.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 		 727 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.95 
 
 		 828 aa  336  9e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 727 aa  336  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.16 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.9 
 
 		 654 aa  334  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.86 
 
 		 640 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 829 aa  332  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.06 
 
 		 728 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  34.97 
 
 		 744 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 640 aa  330  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 709 aa  330  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  36.51 
 
 		 880 aa  330  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  32.71 
 
 		 709 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 709 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 683 aa  328  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 644 aa  327  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 683 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  35.74 
 
 		 683 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 714 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  35.74 
 
 		 683 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  35.55 
 
 		 814 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  35.74 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.8 
 
 		 683 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  36.15 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 		 709 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.04 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  34.19 
 
 		 643 aa  324  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.97 
 
 		 655 aa  324  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  34.19 
 
 		 643 aa  324  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  35.56 
 
 		 683 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  34.68 
 
 		 643 aa  323  5e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 683 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 683 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.65 
 
 		 905 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.4 
 
 		 645 aa  321  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  35.56 
 
 		 683 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 714 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.93 
 
 		 741 aa  320  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 		 705 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.52 
 
 		 776 aa  320  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36 
 
 		 727 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 		 732 aa  319  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 		 654 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 713 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.14 
 
 		 712 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 713 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 713 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  34.93 
 
 		 757 aa  317  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 713 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 713 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 713 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  36.83 
 
 		 746 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  31.64 
 
 		 710 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 728 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  36.65 
 
 		 705 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  31.89 
 
 		 668 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.96 
 
 		 648 aa  313  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.06 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.61 
 
 		 775 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 770 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  36.83 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  36.83 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  36.65 
 
 		 705 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.5 
 
 		 734 aa  310  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  36.65 
 
 		 705 aa  310  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  36.65 
 
 		 705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.27 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  36.83 
 
 		 705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 746 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>