More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0436 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 391 aa  780    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.89 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  33.78 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.45 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  30.56 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  31.83 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  30.69 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  30.08 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  29.55 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.79 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  31.33 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  31.33 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  30.31 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  29.32 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  29.82 
 
 		 379 aa  154  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  29.06 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  29.06 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  28.42 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  26.32 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  27.39 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  28.09 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  28.98 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  27.91 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  26.11 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  26.36 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  28.39 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  26.3 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  25.13 
 
 		 710 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.91 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  24.15 
 
 		 604 aa  89.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  25.66 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  24.43 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  26.82 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  26.7 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  25.79 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  28.8 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  29.35 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  25.13 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  27.91 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  28.57 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  29.32 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  32.6 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  26.47 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  27.84 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  33.58 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  24.88 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf365  GTPase protein YlqF  30.81 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012987  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  27.33 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  25.35 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  24.62 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  28.49 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  22.14 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  27.12 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  24.42 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  27.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.54 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  24.88 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  24.69 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  31.18 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  28.5 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  25.1 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  29.14 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  31.31 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  30.45 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  30.27 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.36 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  28.25 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  24.36 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  22.97 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  30.34 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  22.54 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  31.32 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  22.54 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  22.69 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  22.69 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  22.69 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  22.69 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  24 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  28.9 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  24.45 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  28.18 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  22.51 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  24.14 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  22.22 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  28.25 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  29.32 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  24.88 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>