More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0413 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  70.56 
 
 
469 aa  662    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  100 
 
 
479 aa  973    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  60.62 
 
 
469 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  60.42 
 
 
470 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  61.84 
 
 
470 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  60.08 
 
 
470 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  59.75 
 
 
491 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  61.01 
 
 
470 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545007  hitchhiker  0.000000575338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  61.22 
 
 
470 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  61.01 
 
 
470 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  60.8 
 
 
470 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  61.22 
 
 
470 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  60.17 
 
 
470 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  60.17 
 
 
473 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  60.63 
 
 
469 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  54.71 
 
 
588 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  54.19 
 
 
584 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  53.62 
 
 
583 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  54.47 
 
 
587 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  54.94 
 
 
585 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  56.08 
 
 
585 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  55.88 
 
 
585 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  55.67 
 
 
585 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  55.46 
 
 
585 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  53.75 
 
 
467 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  53.75 
 
 
467 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  51.24 
 
 
585 aa  471  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  50.31 
 
 
577 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  51.65 
 
 
585 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  51.65 
 
 
585 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  51.04 
 
 
578 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  50.83 
 
 
472 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  50.21 
 
 
585 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  49.27 
 
 
580 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  49.79 
 
 
480 aa  443  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  48.97 
 
 
583 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  49.08 
 
 
589 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  50.41 
 
 
590 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  48.16 
 
 
583 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  47.84 
 
 
582 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  47.33 
 
 
474 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  46.41 
 
 
580 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  47.95 
 
 
474 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  47.22 
 
 
473 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  47.12 
 
 
474 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.01 
 
 
582 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  47.63 
 
 
580 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_56445  kinase pyruvate kinase 3  46.23 
 
 
543 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0775  pyruvate kinase  48.05 
 
 
473 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.153908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  46.94 
 
 
586 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  45.81 
 
 
585 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1002  pyruvate kinase  46.73 
 
 
477 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  45.96 
 
 
490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45997  kinase pyruvate kinase 4a  45.49 
 
 
535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.01235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  46.15 
 
 
471 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27502  kinase pyruvate kinase 4b  45.49 
 
 
535 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142086  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27708  predicted protein  48.37 
 
 
527 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0235252 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49098  kinase pyruvate kinase 2  44.76 
 
 
513 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51163  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  50.82 
 
 
572 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  44.65 
 
 
582 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  44.02 
 
 
479 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40662  predicted protein  50.75 
 
 
572 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612902  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  45.4 
 
 
592 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  45.4 
 
 
592 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  45.44 
 
 
596 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  46.68 
 
 
480 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  45.34 
 
 
480 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  45.59 
 
 
481 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  44.24 
 
 
478 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  45.64 
 
 
596 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  45.23 
 
 
596 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.04 
 
 
480 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  45.02 
 
 
597 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  44.65 
 
 
594 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  44.01 
 
 
480 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  45 
 
 
587 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  44.12 
 
 
479 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  41.37 
 
 
476 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  45.17 
 
 
481 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>