More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0342 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  70.4 
 
 		 116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  54.4 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  52 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1880  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 184 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  48 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 113 aa  119  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  49.26 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  48.8 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  48 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.8 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  48.33 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  54.03 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  54.03 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  46.27 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  47.2 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  50.4 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  48.8 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  48 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>