More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0312 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
432 aa  855    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.2 
 
 
428 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.36 
 
 
426 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.24 
 
 
425 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  46.17 
 
 
440 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.87 
 
 
429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.16 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  45.14 
 
 
427 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.37 
 
 
423 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.66 
 
 
439 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.29 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.52 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  43.71 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  43.71 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  42.17 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.51 
 
 
430 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.51 
 
 
430 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.38 
 
 
428 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.2 
 
 
426 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  42.17 
 
 
432 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.56 
 
 
463 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  41.18 
 
 
427 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  41.84 
 
 
419 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  41.38 
 
 
439 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.22 
 
 
428 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.28 
 
 
422 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.22 
 
 
428 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  40.99 
 
 
428 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  41.8 
 
 
435 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  41.97 
 
 
435 aa  296  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  41.84 
 
 
428 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  41.84 
 
 
428 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  41.47 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  41.61 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  41.61 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  41.61 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.85 
 
 
387 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  39.45 
 
 
430 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.15 
 
 
464 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.58 
 
 
338 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.39 
 
 
338 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.52 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.09 
 
 
438 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.97 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  40.14 
 
 
437 aa  286  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  54.04 
 
 
338 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.56 
 
 
464 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.28 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  39.91 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.16 
 
 
346 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  47.54 
 
 
350 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  37.98 
 
 
428 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.53 
 
 
338 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.23 
 
 
338 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.75 
 
 
336 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.57 
 
 
425 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  45.21 
 
 
341 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  47.51 
 
 
362 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.04 
 
 
365 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.67 
 
 
353 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  47.63 
 
 
373 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.35 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  45.21 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  44.69 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  46.97 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  46.97 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  46.67 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.04 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  39.5 
 
 
437 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  47.34 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  40.14 
 
 
439 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  49.16 
 
 
366 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.16 
 
 
364 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  37.7 
 
 
500 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.5 
 
 
364 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  45.89 
 
 
364 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  50.51 
 
 
370 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  46.73 
 
 
370 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  42.37 
 
 
370 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  44.69 
 
 
361 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  43.94 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  45.13 
 
 
379 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.99 
 
 
369 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  44.32 
 
 
402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  50.7 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  45.67 
 
 
370 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  51.89 
 
 
402 aa  269  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  46.06 
 
 
353 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.35 
 
 
408 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.18 
 
 
417 aa  269  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  45.99 
 
 
357 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  47.35 
 
 
408 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  47.35 
 
 
408 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.46 
 
 
454 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  45.43 
 
 
357 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  46.27 
 
 
372 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  44.25 
 
 
355 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  45.71 
 
 
372 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.83 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.02 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>