More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0216 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  71.89 
 
 		 185 aa  273  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 183 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  47.28 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>