More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0194 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 94 aa  186  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  55.91 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  51.22 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  44.09 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  50.62 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  51.85 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  51.22 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  40.91 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  44.32 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  42.42 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  43.3 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  39.77 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  37.63 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  46.34 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  50.6 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  39.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  51.95 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  46.88 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  40.91 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  43.68 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  47.67 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  45.12 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  46.34 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  40.23 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.34 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  47.56 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  46.51 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>