185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0178 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  100 
 
 		 691 aa  1340    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  83.39 
 
 		 600 aa  924    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  42.93 
 
 		 595 aa  356  7.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  40.34 
 
 		 1230 aa  317  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  37.29 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  50.94 
 
 		 1333 aa  263  8e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  70.86 
 
 		 563 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  65.17 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  38.27 
 
 		 1411 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  65.88 
 
 		 1212 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  76.09 
 
 		 998 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  55.84 
 
 		 1014 aa  195  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  56.22 
 
 		 1813 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  31.25 
 
 		 601 aa  184  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.33 
 
 		 1616 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1616 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.33 
 
 		 1616 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.93 
 
 		 1588 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  33.63 
 
 		 827 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  32.81 
 
 		 1854 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 831 aa  132  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 831 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 816 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 816 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 820 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 816 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  34.08 
 
 		 816 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.86 
 
 		 2866 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  31.84 
 
 		 1516 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.33 
 
 		 1549 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.98 
 
 		 1674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  29.04 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  33.46 
 
 		 617 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  34.67 
 
 		 831 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  28.93 
 
 		 536 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  30.87 
 
 		 1471 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  30.87 
 
 		 1471 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  33.62 
 
 		 1654 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  38.6 
 
 		 898 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  38.76 
 
 		 2493 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  35.27 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.58 
 
 		 1117 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  50.42 
 
 		 2091 aa  118  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  35.29 
 
 		 2095 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  31.25 
 
 		 1546 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  50.43 
 
 		 2092 aa  117  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  50.42 
 
 		 2073 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  50.42 
 
 		 2078 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  50.42 
 
 		 2078 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.81 
 
 		 655 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  53.39 
 
 		 2075 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.54 
 
 		 2505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  36.73 
 
 		 404 aa  115  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  34.3 
 
 		 737 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  35.33 
 
 		 3355 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  33.45 
 
 		 2814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.54 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  32.05 
 
 		 2396 aa  112  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  38.61 
 
 		 2728 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  33.45 
 
 		 2778 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  28.31 
 
 		 1613 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  30.42 
 
 		 601 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  38.65 
 
 		 2141 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  33.46 
 
 		 1487 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.63 
 
 		 962 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.92 
 
 		 4384 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  33.24 
 
 		 1068 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  33.07 
 
 		 1186 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.73 
 
 		 1012 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.46 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 2757 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  31.53 
 
 		 810 aa  99  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  51.46 
 
 		 2025 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  28.99 
 
 		 1535 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1122 aa  97.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  29.07 
 
 		 1669 aa  97.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1122 aa  97.4  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  34.72 
 
 		 1916 aa  97.1  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1090 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  31.45 
 
 		 1265 aa  96.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1090 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1090 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1122 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  30.13 
 
 		 1705 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  29.49 
 
 		 1766 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  34.78 
 
 		 2392 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.73 
 
 		 1074 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  50.49 
 
 		 1916 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  29.38 
 
 		 1626 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  26.59 
 
 		 1814 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  29.11 
 
 		 1434 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  29.94 
 
 		 3920 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  29.79 
 
 		 4238 aa  92  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  31.1 
 
 		 1353 aa  91.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  30.84 
 
 		 589 aa  90.9  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  32.39 
 
 		 2868 aa  90.9  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  29.02 
 
 		 2157 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  28.01 
 
 		 2832 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  43.18 
 
 		 740 aa  87.4  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  44.64 
 
 		 977 aa  87.4  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>