More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0160 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
328 aa  683    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  62.73 
 
 
335 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  58.95 
 
 
335 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  42.72 
 
 
334 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  38.02 
 
 
313 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  37.13 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  37.05 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  36.12 
 
 
310 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  35.5 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 
313 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  34.76 
 
 
312 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  32.24 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
323 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  49.43 
 
 
406 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
632 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  35.17 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.44 
 
 
357 aa  160  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 
423 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
423 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 
329 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  32 
 
 
364 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  34.85 
 
 
379 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  33.44 
 
 
324 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 
468 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.49 
 
 
319 aa  154  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  30.32 
 
 
443 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
416 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.72 
 
 
329 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  31.04 
 
 
327 aa  150  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
438 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.33 
 
 
328 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 
370 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
415 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.22 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 
360 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  32.36 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  32.1 
 
 
348 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  32.12 
 
 
305 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
373 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.87 
 
 
489 aa  142  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  32.94 
 
 
417 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.08 
 
 
405 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  31.77 
 
 
412 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.77 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
416 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
662 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.81 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.16 
 
 
415 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  32.13 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  41.01 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  41.01 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  32.81 
 
 
320 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
465 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
393 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.94 
 
 
350 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
415 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.01 
 
 
395 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.77 
 
 
395 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
372 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
325 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
395 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  40.1 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
358 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
727 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  31.59 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.76 
 
 
431 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.49 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  39.77 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  31.14 
 
 
495 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.09 
 
 
387 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.19 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  38.32 
 
 
456 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.79 
 
 
657 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  38.32 
 
 
456 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.77 
 
 
381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
402 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
398 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
365 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
342 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 
318 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
336 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
337 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
318 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.33 
 
 
388 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.6 
 
 
362 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>