45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0139 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  100 
 
 
324 aa  652    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  59.27 
 
 
335 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  57.14 
 
 
325 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  57.73 
 
 
326 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  57.73 
 
 
326 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  54.6 
 
 
326 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  54.21 
 
 
325 aa  363  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  52.88 
 
 
317 aa  347  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  52.12 
 
 
331 aa  334  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  48.92 
 
 
336 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  53.14 
 
 
327 aa  321  8e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  50.31 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  49.23 
 
 
346 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  48.59 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  47.96 
 
 
346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  49.52 
 
 
331 aa  309  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  47.04 
 
 
334 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  28.79 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  29.09 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.96 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.8 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.44 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.76 
 
 
329 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  24.05 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.07 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  22.74 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.86 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  24.19 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  23.49 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  23.49 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  23.49 
 
 
292 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  23.49 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  23.49 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.17 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  22.22 
 
 
292 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  22.22 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  22.22 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  22.22 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  22.22 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  22.22 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  24.29 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.29 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  24.29 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  22.93 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>