More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0136 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  100 
 
 
314 aa  608  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  77.71 
 
 
314 aa  478  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
341 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
341 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
322 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  39.47 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  42.19 
 
 
320 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
330 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  32.81 
 
 
330 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  32.81 
 
 
336 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  33.44 
 
 
335 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  33.02 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  41.75 
 
 
333 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  41.75 
 
 
333 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
321 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
254 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
328 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  35.19 
 
 
334 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  37.59 
 
 
324 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  31.41 
 
 
318 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
330 aa  185  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  35.98 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  30.43 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
261 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  33.83 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.42 
 
 
341 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  29.6 
 
 
333 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  35.14 
 
 
328 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  31.76 
 
 
329 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  41.05 
 
 
317 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
337 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  36.18 
 
 
331 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
337 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  38.68 
 
 
265 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 
337 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  36.95 
 
 
337 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  39.62 
 
 
285 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
337 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  35.23 
 
 
329 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  35.23 
 
 
329 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
328 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  37.6 
 
 
328 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  34.75 
 
 
324 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  34.56 
 
 
325 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  29.5 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  39.83 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  33.58 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  30.43 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  40.25 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.54 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  39.51 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  35.92 
 
 
292 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  39.41 
 
 
331 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
343 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  35.37 
 
 
332 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  30.46 
 
 
333 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  34.96 
 
 
332 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  31.25 
 
 
324 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
334 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
334 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  33.09 
 
 
336 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  32.93 
 
 
334 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  31.32 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  30.15 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  38.14 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  27.9 
 
 
337 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  37.2 
 
 
324 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  38.14 
 
 
331 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  34.03 
 
 
332 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 
338 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
326 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  36.32 
 
 
332 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  31.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  29.15 
 
 
326 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  33.45 
 
 
324 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  35.89 
 
 
262 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
329 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  34.45 
 
 
302 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  36.47 
 
 
309 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  37.77 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  35.92 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  34.17 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  37.77 
 
 
338 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  37.77 
 
 
338 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  32.33 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  33.33 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  34 
 
 
239 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
308 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  35.71 
 
 
242 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>