51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0131 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  63.04 
 
 
234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  61.04 
 
 
232 aa  278  6e-74  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  57.83 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  51.48 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  50.64 
 
 
241 aa  248  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  51.09 
 
 
234 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  51.74 
 
 
235 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  41.33 
 
 
241 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  30.73 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.22 
 
 
240 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  30.58 
 
 
228 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  35.4 
 
 
235 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  37.41 
 
 
227 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  37.5 
 
 
236 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  35.03 
 
 
228 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  36.08 
 
 
228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  36.08 
 
 
228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  34.39 
 
 
228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  35.44 
 
 
228 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  32.75 
 
 
228 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  28.78 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  33.1 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  31.72 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  33.58 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  28.99 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  29.8 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  27.12 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  32.37 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  22.91 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  24.57 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  24.89 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  28.49 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  27.84 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  25.96 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  26.58 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  22.03 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.48 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  33.33 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  22.75 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  26.29 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  23.81 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  20.72 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  24.88 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  28.25 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  29 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0925  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000509221  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  23.59 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.87 
 
 
801 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
801 aa  42.4  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>