More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0097 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 455 aa  900    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  67.9 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  49.79 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  45.92 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  46.51 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  45.89 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  45.18 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  44.59 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  46.42 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  46.62 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  46.3 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  46.85 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  46.88 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  44.86 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  45.53 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.93 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  45.55 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  44.18 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.49 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.8 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  42.71 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  42.49 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  47.51 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  42.34 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  41.87 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  46.02 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  43.14 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  42.28 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  42.21 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  41.13 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  40.58 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 459 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  43.39 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  43.57 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  43.99 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 		 461 aa  348  8e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  43.29 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  44.23 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 460 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.1 
 
 		 471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  42.27 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  38.89 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  40.13 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 464 aa  325  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  40.72 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 		 460 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 462 aa  319  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  35.99 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  35.77 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 518 aa  309  5.9999999999999995e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 456 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 452 aa  302  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 447 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  37.07 
 
 		 475 aa  299  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 476 aa  298  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  33.92 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  35.57 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  34.88 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 452 aa  286  8e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>