More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0095 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  50.49 
 
 
219 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  46.34 
 
 
542 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.06 
 
 
545 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
558 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  43.69 
 
 
556 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  43.69 
 
 
556 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  41.75 
 
 
255 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.35 
 
 
557 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  40.91 
 
 
258 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  40.91 
 
 
255 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  41.46 
 
 
255 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 
550 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  41.21 
 
 
255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.75 
 
 
567 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  41.95 
 
 
562 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.75 
 
 
554 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.75 
 
 
554 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
544 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  40.78 
 
 
545 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.78 
 
 
548 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.79 
 
 
543 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
553 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
552 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
552 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  38.89 
 
 
536 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
546 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
546 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
546 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
581 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  42.23 
 
 
557 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  40.21 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.11 
 
 
548 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  39.91 
 
 
223 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.28 
 
 
548 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.79 
 
 
543 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
560 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
560 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
560 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.26 
 
 
560 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
553 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  43.36 
 
 
231 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  41.4 
 
 
553 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.38 
 
 
552 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.38 
 
 
552 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.87 
 
 
541 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
554 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  36.11 
 
 
539 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
553 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  41.31 
 
 
541 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.78 
 
 
560 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.32 
 
 
555 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  39.63 
 
 
300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.29 
 
 
543 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  38.36 
 
 
617 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  37.8 
 
 
607 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  40.76 
 
 
609 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  37.16 
 
 
217 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  40.85 
 
 
541 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.89 
 
 
600 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  40.47 
 
 
544 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 
533 aa  145  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  40.29 
 
 
562 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  40.85 
 
 
541 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  41.51 
 
 
542 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  41.87 
 
 
540 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  42.93 
 
 
557 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  40.38 
 
 
541 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 
540 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  40 
 
 
566 aa  144  9e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  40.09 
 
 
545 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
563 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  38.12 
 
 
570 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  37.9 
 
 
624 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  40.38 
 
 
541 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  38.94 
 
 
584 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>