88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0093 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 109 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  46.73 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.27 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  29.91 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  29.91 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  28.97 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  34 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  41.43 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  34 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  28.97 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  48.44 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.25 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  39.58 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  28.3 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.38 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  42.19 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  25.23 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  32.08 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  33.02 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  55.32 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  28.3 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  25.93 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  29.63 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  29.63 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.04 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.1 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  27.08 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  29.13 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  28.7 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  28.83 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  28.83 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  29.2 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  26.92 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  43.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  32.04 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.88 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  23.64 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  28.16 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  32.98 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  31.13 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  47.27 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  25.71 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.08 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  31.75 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  26 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 81 aa  42  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  25.69 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 189 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  27.88 
 
 		 109 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  37.5 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  37.36 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.23 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.65 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  35.82 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.36 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.78 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.01 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  39.39 
 
 		 127 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>