More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0092 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.9  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 45 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 47 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 52 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 48 aa  60.8  0.000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  70.45 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 46 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 52 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 51 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 45 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 50 aa  57  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6487  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00156279  normal  0.0851435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  67.44 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 53 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 48 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>