More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0060 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
329 aa  675    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  83.02 
 
 
327 aa  550  1e-155  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  71.04 
 
 
338 aa  481  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  66.36 
 
 
324 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.86 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  42.38 
 
 
318 aa  242  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  41.59 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  41.46 
 
 
305 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  41.05 
 
 
416 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  43.65 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  42.41 
 
 
417 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  40.18 
 
 
416 aa  232  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  39.47 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  41.87 
 
 
323 aa  216  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  40.37 
 
 
727 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  40.67 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  39.47 
 
 
419 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  38.4 
 
 
436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  37.82 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  40.18 
 
 
415 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  38.34 
 
 
320 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  39.48 
 
 
417 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  38.11 
 
 
336 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  36.7 
 
 
657 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  37.61 
 
 
406 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  39.71 
 
 
425 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  38.79 
 
 
319 aa  204  2e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  39.71 
 
 
424 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  36.75 
 
 
426 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.47 
 
 
418 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  36.84 
 
 
417 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  37.33 
 
 
491 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  38.05 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  36.99 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  36.99 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  36.99 
 
 
476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  36.99 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  36.99 
 
 
476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.51 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  35.81 
 
 
474 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  36.73 
 
 
487 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  33.91 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  36.16 
 
 
472 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
472 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  35.89 
 
 
472 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  35.89 
 
 
472 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  35.89 
 
 
472 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  35.89 
 
 
472 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  35.62 
 
 
472 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  34.25 
 
 
471 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  36.34 
 
 
447 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.3 
 
 
451 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  46.24 
 
 
438 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.29 
 
 
437 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.06 
 
 
313 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 
328 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.18 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  44.5 
 
 
460 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  44.5 
 
 
460 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
334 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 
444 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
383 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
423 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 
423 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
308 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.23 
 
 
495 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
350 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
323 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  39.18 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  42.39 
 
 
456 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  42.39 
 
 
456 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 
368 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  41.57 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  32.08 
 
 
373 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  27.66 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  40.31 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
427 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  31.14 
 
 
352 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.22 
 
 
406 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.3 
 
 
435 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
395 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
359 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.14 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.16 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 
321 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  35.68 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
313 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 
379 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
335 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
375 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.16 
 
 
357 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
407 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
337 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>