158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0041 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  52.31 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  59.02 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.45 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  54.69 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  50 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  54.1 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  50.82 
 
 
72 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  52.46 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  52.46 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.62 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.79 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  46.15 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  45.45 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  43.08 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  45.31 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.12 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  49.23 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  51.67 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  55 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  42.62 
 
 
80 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  45.9 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.12 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  39.39 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  49.15 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  48.33 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  46.67 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2636  putative RNA-binding protein  47.46 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  44.62 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.88 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  41.79 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  42.19 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  40.91 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2973  hypothetical protein  45.31 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
92 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07580  hypothetical protein  43.86 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.87858  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  45.31 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3228  hypothetical protein  43.75 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  45.9 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.15 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  39.68 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  44.62 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.28 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1167  hypothetical protein  41.94 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.39 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  45.61 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  40.98 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  39.39 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  48.28 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  34.33 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  34.33 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.07 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  45.28 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  50 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  45.76 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  46 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  46.67 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3013  hypothetical protein  43.33 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000402743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1280  hypothetical protein  43.33 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000730954  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3151  hypothetical protein  43.33 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0026915  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  44.83 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  41.51 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  45.45 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0526  hypothetical protein  38.33 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  44.83 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  34.33 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  36.36 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  34.33 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  44.9 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.68 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  36.36 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  35.94 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2468  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.68 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  37.88 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  44.83 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  43.4 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  45.76 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  42.37 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.61 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.37 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.37 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>