242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0034 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0034  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
430 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  23.47 
 
 
408 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  22.61 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  25.38 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  31.87 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
433 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  30.63 
 
 
414 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  21.47 
 
 
428 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  29.38 
 
 
414 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
415 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  21.65 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  20.25 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  21.65 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  21.65 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  23.78 
 
 
435 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  24.83 
 
 
416 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  21.65 
 
 
378 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  22.61 
 
 
417 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
441 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  21.65 
 
 
378 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  21.65 
 
 
378 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.02 
 
 
418 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  24 
 
 
461 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
439 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.5 
 
 
412 aa  62  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.6 
 
 
405 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.6 
 
 
405 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  25.34 
 
 
439 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
499 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 
423 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
448 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  18.49 
 
 
417 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.26 
 
 
421 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 
406 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.47 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  20.6 
 
 
427 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.47 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.47 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.12 
 
 
408 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  21.34 
 
 
434 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  23.4 
 
 
148 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  23.46 
 
 
426 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 
405 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.47 
 
 
408 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  25 
 
 
485 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  30.43 
 
 
420 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  21.66 
 
 
445 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  20.42 
 
 
420 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  21.18 
 
 
432 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.33 
 
 
390 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
432 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
463 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.33 
 
 
390 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.51 
 
 
408 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.77 
 
 
414 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.64 
 
 
408 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
433 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
415 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  20.81 
 
 
444 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  23.21 
 
 
416 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  21.88 
 
 
420 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  21.88 
 
 
420 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
397 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
409 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  21.88 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  21.88 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  19.41 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  19.41 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  28 
 
 
414 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  21.35 
 
 
420 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  20.81 
 
 
420 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.55 
 
 
439 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
412 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  31.91 
 
 
462 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
444 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  18.41 
 
 
408 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  25.2 
 
 
405 aa  52.8  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  27.69 
 
 
1769 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  24.06 
 
 
454 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
421 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  31.9 
 
 
415 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.83 
 
 
1829 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  27.52 
 
 
547 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  28.57 
 
 
414 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 
450 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  31.29 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  31.29 
 
 
415 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  31.29 
 
 
415 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  31.29 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.37 
 
 
412 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  31.29 
 
 
415 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
421 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>