113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0023 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  41.75 
 
 
235 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  39.57 
 
 
245 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  39.57 
 
 
245 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
335 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  40.2 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  38.53 
 
 
259 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  37.56 
 
 
267 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  36.73 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 
277 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  35.68 
 
 
345 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 
334 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  34.48 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  35.18 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
355 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  35.18 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  35.18 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  35.2 
 
 
263 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
294 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  36.04 
 
 
363 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  35.15 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  35.03 
 
 
329 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  33.76 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  32.54 
 
 
277 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  32.54 
 
 
277 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  35.2 
 
 
257 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 
282 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  35.57 
 
 
265 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  34.76 
 
 
255 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  33.95 
 
 
249 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  35.05 
 
 
265 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  34 
 
 
282 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  35.2 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  33.33 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.15 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  33.83 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  33.83 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  33.83 
 
 
272 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  33.17 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  33.33 
 
 
272 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  32.49 
 
 
340 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  33.33 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 
279 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 
292 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  28.99 
 
 
574 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  32.02 
 
 
286 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  28.71 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  29.8 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  25.48 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  27.64 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  27.32 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  24.87 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  25.38 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  26.42 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 
399 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  23.53 
 
 
348 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 
348 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  26.63 
 
 
291 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.99 
 
 
348 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.52 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.04 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  27.23 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  26.24 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  26.77 
 
 
320 aa  58.9  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 
496 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 
321 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  23.96 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  22.73 
 
 
935 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  23.44 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
829 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 
337 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  23.7 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  22.54 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  25.73 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  23.65 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  25.13 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.37 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  34.67 
 
 
323 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
628 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  25.54 
 
 
491 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.53 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  22.63 
 
 
592 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
331 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.53 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  25.27 
 
 
265 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  25.27 
 
 
265 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  26.15 
 
 
380 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0568  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  21.55 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0253119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>