More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0014 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  259  8.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  79.53 
 
 		 132 aa  207  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  61.42 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  62.99 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  64.29 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  59.84 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.63 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  59.52 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  59.38 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 129 aa  143  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 129 aa  141  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  55.91 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  52.34 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  55.65 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>