275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6225 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  100 
 
 
297 aa  607  1e-172  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  92.49 
 
 
295 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  90.85 
 
 
295 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  91.1 
 
 
299 aa  534  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  91.46 
 
 
298 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  90.75 
 
 
300 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  89.12 
 
 
298 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  90.39 
 
 
299 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  90.39 
 
 
299 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  90.39 
 
 
299 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  85.57 
 
 
295 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  81.51 
 
 
296 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  81.51 
 
 
296 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  84.17 
 
 
296 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  81.72 
 
 
293 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  84.53 
 
 
293 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  81.38 
 
 
293 aa  493  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  86.22 
 
 
312 aa  493  1e-138  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  81.38 
 
 
293 aa  492  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  79.45 
 
 
295 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  79.11 
 
 
295 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  79.79 
 
 
293 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  80 
 
 
293 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  80 
 
 
303 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  86.57 
 
 
291 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  86.57 
 
 
291 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  83.94 
 
 
290 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  80 
 
 
293 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  76.9 
 
 
326 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  74.48 
 
 
296 aa  453  1e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  74.39 
 
 
295 aa  452  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  77.62 
 
 
324 aa  453  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  74.1 
 
 
296 aa  447  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  73.97 
 
 
297 aa  438  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  74.66 
 
 
299 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  72.66 
 
 
298 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.43 
 
 
287 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  70.36 
 
 
289 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  73.74 
 
 
299 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  72.24 
 
 
292 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  69.55 
 
 
290 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  70 
 
 
293 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  72.76 
 
 
288 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.63 
 
 
296 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  73.09 
 
 
275 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  77.52 
 
 
296 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  70.25 
 
 
288 aa  415  1e-115  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  72.3 
 
 
296 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.89 
 
 
296 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  72.3 
 
 
296 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  67.47 
 
 
291 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  72.07 
 
 
289 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  74.19 
 
 
288 aa  406  1e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  70.59 
 
 
290 aa  407  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  71.53 
 
 
289 aa  399  1e-110  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.17 
 
 
289 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  71.33 
 
 
289 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  71.17 
 
 
289 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  70.25 
 
 
288 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  71.33 
 
 
288 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  65.94 
 
 
284 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  64.36 
 
 
275 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  66.42 
 
 
272 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  61.51 
 
 
276 aa  354  8e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  64.36 
 
 
276 aa  354  9e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  3.68653e-05  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  62.55 
 
 
274 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  62.01 
 
 
277 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  65.09 
 
 
274 aa  352  3e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
274 aa  351  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  63.27 
 
 
276 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  61.59 
 
 
274 aa  349  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  62.41 
 
 
273 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  60.22 
 
 
276 aa  341  8e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  60.81 
 
 
275 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  62.04 
 
 
273 aa  337  2e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  62.41 
 
 
273 aa  335  6e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  63.64 
 
 
274 aa  335  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  62.91 
 
 
274 aa  334  8e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.40583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  60.58 
 
 
275 aa  334  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  63.27 
 
 
274 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  63.27 
 
 
274 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  59.49 
 
 
275 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  62.18 
 
 
274 aa  332  7e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  59.85 
 
 
275 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  58.39 
 
 
275 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  59.71 
 
 
280 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  58.55 
 
 
275 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  60.95 
 
 
283 aa  328  8e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  57.82 
 
 
275 aa  326  4e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  58.39 
 
 
275 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  57.09 
 
 
275 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  56.73 
 
 
275 aa  321  8e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  55.43 
 
 
275 aa  307  1e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  53.31 
 
 
272 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  52.61 
 
 
280 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  50.74 
 
 
270 aa  275  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  51.84 
 
 
272 aa  263  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  45.59 
 
 
276 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  46.15 
 
 
324 aa  253  2e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  48.31 
 
 
291 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>