35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5967 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  51.25 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  49.33 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  55.7 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  53.75 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  58.06 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  58.06 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  49.37 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  51.39 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  54.84 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  48.57 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  49.25 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  53.97 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  48.57 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  45.71 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  47.83 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  50.63 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  53.33 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  44.78 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  41.43 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  39.71 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  39.71 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  40.85 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  48.84 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  52.38 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  52.38 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  36.49 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  46.67 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  39.66 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  37.68 
 
 		 155 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  29.17 
 
 		 98 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1422 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>