33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5877 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  58.55 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  46.99 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  40.66 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  36.21 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  34.57 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  36.21 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  34.57 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  36.21 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  35.39 
 
 		 335 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  36.21 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  35.39 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  37 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  33.47 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  32.1 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  38.01 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  36.82 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  33.33 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  24.54 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  27.45 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  44.83 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01305  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0466824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4132  adenylate cyclase  40 
 
 		 807 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.929537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>