More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5745 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 318 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.06 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  47.16 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  43.1 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  49.47 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  44.25 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  46.5 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  42.21 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.12 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.95 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  44.19 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.53 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.53 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.33 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.8 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.67 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.01 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  46.91 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  46.91 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.4 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.97 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.74 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.74 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.4 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.4 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.2 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  42.57 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.61 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  38.85 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.05 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  45.9 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.33 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.33 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.12 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.27 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.2 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  42.81 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  41.58 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.12 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 349 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  40.66 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.32 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 		 835 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  42 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  45.57 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  43.27 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  39.35 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  45.57 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  38.89 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  44.92 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  45.39 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  42.32 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.71 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  39.34 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>