226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5612 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  69.32 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  67.05 
 
 		 97 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  66.29 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  78.21 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  65.91 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  59.34 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  65.91 
 
 		 97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  68.18 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  63.22 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  62.07 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  61.29 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  59.09 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  60.47 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  58.24 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  60.22 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  59.3 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  54.44 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  53.41 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  63.49 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  50.57 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  47.62 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  49.18 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  40.85 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  40.85 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  49.09 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  37.18 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  49.09 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  33.77 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  46.03 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  31.4 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  40.91 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  30.77 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40.68 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  43.64 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  42.37 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  43.64 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  38.81 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  34.67 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  37.1 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  33.82 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  29.67 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  39.34 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  42.19 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  37.31 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  34.92 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  35.94 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  31.46 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  29.55 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  40.74 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  32.31 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  34.25 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  37.68 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  35.9 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  34.57 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  40.35 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  32.86 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  40.28 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  40.28 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  31.58 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  35.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  33.33 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  32.35 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>