184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5358 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  64.32 
 
 		 567 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  62.21 
 
 		 571 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  62.28 
 
 		 567 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  61.51 
 
 		 567 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  60.35 
 
 		 567 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  60.88 
 
 		 567 aa  675    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  59.05 
 
 		 569 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  60.28 
 
 		 567 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  63.62 
 
 		 571 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  60.7 
 
 		 567 aa  688    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  61.51 
 
 		 571 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 		 569 aa  1116    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  61.86 
 
 		 571 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  60.98 
 
 		 567 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  65.73 
 
 		 567 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  72.06 
 
 		 569 aa  829    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  59.58 
 
 		 571 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  63.09 
 
 		 571 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  59.4 
 
 		 569 aa  631  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  59.3 
 
 		 567 aa  617  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  54.78 
 
 		 590 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1096  potassium-transporting ATPase subunit A  60.88 
 
 		 568 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  55.12 
 
 		 590 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  54.78 
 
 		 590 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  56.14 
 
 		 579 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  52.87 
 
 		 592 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4242  potassium-transporting ATPase subunit A  56.81 
 
 		 569 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.06 
 
 		 572 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  54.64 
 
 		 595 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.3 
 
 		 582 aa  579  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.69 
 
 		 572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  55.26 
 
 		 562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  54.13 
 
 		 571 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  53.4 
 
 		 592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  55.08 
 
 		 562 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  54.56 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  57.89 
 
 		 575 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  54.9 
 
 		 562 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  52.53 
 
 		 592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  53.4 
 
 		 586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  52.28 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  52.98 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.26 
 
 		 568 aa  560  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  55.42 
 
 		 576 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  52.67 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.67 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  53.46 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  53.64 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  53.46 
 
 		 559 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  52.39 
 
 		 605 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  53.64 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  51.68 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  52.67 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  52.67 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  52.67 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  53.94 
 
 		 561 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  52.31 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  52.31 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  52.93 
 
 		 559 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  52.49 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1265  potassium-transporting ATPase subunit A  57.03 
 
 		 551 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  51.96 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  53.04 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3488  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.66 
 
 		 565 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.515132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  54.15 
 
 		 564 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.13 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  53.79 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2923  potassium-transporting ATPase subunit A  57.03 
 
 		 551 aa  545  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.519235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.71 
 
 		 811 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  52.52 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  51.76 
 
 		 564 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  51.94 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  51.94 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  52.11 
 
 		 601 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  51.39 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  54.14 
 
 		 562 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  51.34 
 
 		 601 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  53.33 
 
 		 564 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5925  potassium-transporting ATPase subunit A  51.4 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  52.79 
 
 		 601 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  54.73 
 
 		 562 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  50.17 
 
 		 578 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  51.6 
 
 		 601 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0708  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.48 
 
 		 565 aa  528  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 		 602 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1440  potassium-transporting ATPase A subunit  51.62 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1707  potassium-transporting ATPase subunit A  52.43 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  52.54 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  51.33 
 
 		 601 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0722  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.31 
 
 		 576 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2383  potassium-transporting ATPase subunit A  50.88 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3486  potassium-transporting ATPase subunit A  53.15 
 
 		 564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1876  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 		 602 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4033  potassium-transporting ATPase subunit A  53.25 
 
 		 564 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.845156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2577  potassium-transporting ATPase subunit A  47.56 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0053  potassium-transporting ATPase subunit A  52.66 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1083  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 		 602 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0784  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 		 602 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0366  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 		 602 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>