More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5346 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  52.31 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  52.31 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  48.11 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  48.1 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  40.5 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.18 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.18 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.18 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.18 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.87 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  27.73 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.27 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.19 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.89 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.77 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  35.54 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  26.51 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  35.24 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  26.58 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.63 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.91 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.12 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.87 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  45.95 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  24.76 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.82 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.83 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.82 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  24.84 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.57 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  27.86 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  27.86 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  27.45 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.01 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.35 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>