More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5138 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  67.91 
 
 		 507 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  66.13 
 
 		 518 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  75.05 
 
 		 504 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  68.04 
 
 		 507 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  67.81 
 
 		 511 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  65 
 
 		 504 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  68.81 
 
 		 503 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  68.34 
 
 		 505 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  68.01 
 
 		 503 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  61.11 
 
 		 504 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  74.4 
 
 		 504 aa  787    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  74.65 
 
 		 504 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  72.31 
 
 		 506 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  68.12 
 
 		 510 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  69.84 
 
 		 509 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  66.6 
 
 		 503 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  66.4 
 
 		 509 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 510 aa  1039    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  68.12 
 
 		 510 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  68.74 
 
 		 508 aa  707    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  68.12 
 
 		 510 aa  691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  61.71 
 
 		 506 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  62.93 
 
 		 504 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  57.65 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  59.21 
 
 		 501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  59.21 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  63.13 
 
 		 503 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  59.67 
 
 		 512 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  58.01 
 
 		 517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  55.79 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  55.79 
 
 		 536 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  57.48 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  55.6 
 
 		 519 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  57.49 
 
 		 539 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  57.56 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.75 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  57.46 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  61.56 
 
 		 517 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  56.69 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  54.05 
 
 		 547 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  55.1 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  54.04 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  55.95 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  55.49 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  54.12 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  44.14 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  43.29 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 		 514 aa  309  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 508 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 566 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 508 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 		 506 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 551 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 498 aa  287  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 527 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 518 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 565 aa  283  8.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.81 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 512 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.81 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 505 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 590 aa  280  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 510 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 502 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 		 510 aa  279  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.32 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.97 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.21 
 
 		 516 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 500 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 		 561 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 582 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 543 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>