77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5124 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  100 
 
 		 141 aa  279  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  61.15 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  39.71 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  29.41 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  39.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  38.1 
 
 		 211 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  33.71 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  33.8 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  42.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  60.47 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  50 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  47.06 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  31.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  52 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  50 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  42.11 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  50 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  58.14 
 
 		 722 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  58.14 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  58.14 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  39.62 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  33.82 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  31.45 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  50 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  32.31 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  50 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  40.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  38.36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  37.5 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  33.82 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  37.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  38.03 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  34.78 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  27.48 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  38.1 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  31.4 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  36.62 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  47.92 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  27.78 
 
 		 432 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  47.92 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  38.98 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  47.92 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  47.92 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  34.82 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  40 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  51.06 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  37.5 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  36.36 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  37.29 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  34.02 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  32.95 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  27.27 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  36.51 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  40.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  42.62 
 
 		 165 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  38.98 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.07 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  43.4 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  43.4 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  34.72 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  38.24 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  32.89 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  40.85 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  34.62 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  36.36 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>