More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5014 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  100 
 
 		 695 aa  1400    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  35.67 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  38.1 
 
 		 662 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  37.39 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  38.76 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  36.54 
 
 		 671 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  36.67 
 
 		 629 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  35.44 
 
 		 695 aa  340  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  36.12 
 
 		 647 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  35.29 
 
 		 642 aa  336  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  37.67 
 
 		 630 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  34.93 
 
 		 667 aa  330  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  33.53 
 
 		 656 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  33.79 
 
 		 656 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  34.3 
 
 		 675 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  35.74 
 
 		 695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  34.82 
 
 		 635 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.87 
 
 		 632 aa  319  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  36.02 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  33.93 
 
 		 665 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  31.26 
 
 		 629 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  35.63 
 
 		 673 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  33.99 
 
 		 645 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.76 
 
 		 684 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  32.4 
 
 		 643 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.94 
 
 		 679 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  33.99 
 
 		 683 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.99 
 
 		 658 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  36.17 
 
 		 635 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  35.66 
 
 		 691 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  34.32 
 
 		 759 aa  281  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.48 
 
 		 690 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.91 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  32.13 
 
 		 662 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 660 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.04 
 
 		 660 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  28.11 
 
 		 657 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.9 
 
 		 660 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.96 
 
 		 657 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.48 
 
 		 645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  29.03 
 
 		 695 aa  259  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  29.24 
 
 		 642 aa  256  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  33.22 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.22 
 
 		 658 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  35.33 
 
 		 634 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  32.42 
 
 		 628 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.22 
 
 		 658 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  32.58 
 
 		 679 aa  250  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  32.42 
 
 		 651 aa  250  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  34.37 
 
 		 654 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  30.5 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.89 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29.18 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  34.17 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  32.13 
 
 		 637 aa  244  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.03 
 
 		 690 aa  239  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.69 
 
 		 639 aa  238  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.62 
 
 		 615 aa  233  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 658 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  30.01 
 
 		 690 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  35.07 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  30.68 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  32.61 
 
 		 678 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  31.23 
 
 		 621 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  27.7 
 
 		 711 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.68 
 
 		 675 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.11 
 
 		 638 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.62 
 
 		 681 aa  217  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  29.32 
 
 		 652 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.36 
 
 		 682 aa  207  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  36.86 
 
 		 625 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.99 
 
 		 688 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.55 
 
 		 716 aa  201  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.48 
 
 		 675 aa  200  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  36.34 
 
 		 718 aa  196  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 675 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  28.4 
 
 		 632 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.29 
 
 		 679 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  30.83 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 726 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 726 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 726 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  32.71 
 
 		 598 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  36.8 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.75 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  36.8 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.24 
 
 		 583 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  29.87 
 
 		 760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  28.67 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.31 
 
 		 720 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  31.44 
 
 		 603 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 685 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.06 
 
 		 690 aa  177  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  36.64 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  39.67 
 
 		 720 aa  170  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  26.87 
 
 		 696 aa  168  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  26.13 
 
 		 690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0472  putative acyltransferase  29.12 
 
 		 702 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1805  O-antigen acetylase  37.43 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>