17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5002 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5002  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 786 aa  1628    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000902541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 		 834 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  28.38 
 
 		 726 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1777  hypothetical protein  22.18 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.245156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 425 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 280 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 315 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  24.47 
 
 		 272 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  31.36 
 
 		 316 aa  48.9  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 311 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 345 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  29.66 
 
 		 664 aa  46.6  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 303 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.86 
 
 		 560 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 335 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 307 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>