237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4943 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  100 
 
 		 335 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  45.18 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  38.74 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  37.24 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  35.22 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  37.43 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  40 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  36.52 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  36.78 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  34.62 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  37.09 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  37.64 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  36.15 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  35.95 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  38.22 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  34.93 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  35.91 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.81 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  34.91 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  34.1 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  33.53 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  34.32 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  34.12 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  35.04 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  34.5 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  35.08 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  31.9 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  35.35 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  31.83 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  34.44 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  32.35 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  34.44 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  37.84 
 
 		 384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.75 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.21 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.05 
 
 		 382 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  32.1 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  31.93 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  29.55 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.92 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.97 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.49 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  32.77 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  32.77 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.05 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  30.64 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  33.76 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  31.28 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.55 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  36.71 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.47 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.52 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.44 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.17 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  32.87 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  31.63 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.01 
 
 		 639 aa  67  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.7 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.36 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  28.08 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  28.92 
 
 		 671 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.01 
 
 		 645 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.65 
 
 		 642 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.81 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  37.36 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  31.97 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  37.5 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.74 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  29.25 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.13 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  31.99 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 684 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  28.45 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.8 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  25.34 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  26.65 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.69 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.11 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  27.54 
 
 		 628 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.5 
 
 		 716 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  29.7 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.3 
 
 		 603 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  29.39 
 
 		 691 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.3 
 
 		 603 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 656 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.26 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  41.43 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>