More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4941 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  66 
 
 		 596 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  60.27 
 
 		 605 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  69.85 
 
 		 669 aa  781    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  59.59 
 
 		 595 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.68 
 
 		 669 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  69.68 
 
 		 669 aa  780    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  70.29 
 
 		 620 aa  829    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  69.68 
 
 		 669 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.68 
 
 		 669 aa  780    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  69.85 
 
 		 669 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  58.95 
 
 		 599 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  61.4 
 
 		 581 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  60.77 
 
 		 599 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  69.95 
 
 		 620 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  68.89 
 
 		 622 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  70.63 
 
 		 620 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  69.68 
 
 		 663 aa  790    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.85 
 
 		 669 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  64.3 
 
 		 600 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  62.39 
 
 		 595 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  71.79 
 
 		 625 aa  860    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  71.45 
 
 		 625 aa  856    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  70.63 
 
 		 620 aa  847    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  64.42 
 
 		 600 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  71.36 
 
 		 626 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  62.05 
 
 		 595 aa  710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  70.63 
 
 		 620 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  74.3 
 
 		 603 aa  890    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  68.74 
 
 		 572 aa  812    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  72.77 
 
 		 601 aa  872    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  100 
 
 		 604 aa  1212    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  65.5 
 
 		 596 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  70.29 
 
 		 620 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  56.17 
 
 		 630 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  49.48 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  51.46 
 
 		 585 aa  554  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  43.25 
 
 		 591 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  48.58 
 
 		 596 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  45.34 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.49 
 
 		 595 aa  345  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  38.2 
 
 		 597 aa  340  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.92 
 
 		 598 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  35.51 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  35.17 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  35.46 
 
 		 640 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  34.93 
 
 		 567 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.97 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.84 
 
 		 603 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  37.32 
 
 		 655 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 		 621 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.81 
 
 		 594 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.03 
 
 		 643 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  34.52 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.04 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  35.45 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 589 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.62 
 
 		 610 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.22 
 
 		 621 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  38.05 
 
 		 621 aa  309  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.1 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.1 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  35.68 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  35.53 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.88 
 
 		 622 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.73 
 
 		 637 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.18 
 
 		 657 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  33.94 
 
 		 652 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  33.22 
 
 		 637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  33.22 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  36.73 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  34.76 
 
 		 630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.5 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  34.18 
 
 		 655 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  34.68 
 
 		 606 aa  303  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  33.05 
 
 		 637 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  35.54 
 
 		 626 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  33.5 
 
 		 663 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.57 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  37.32 
 
 		 651 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.57 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  33.5 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  34.24 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  36.84 
 
 		 644 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  36.35 
 
 		 624 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.93 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  38.25 
 
 		 624 aa  300  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  37.06 
 
 		 663 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  35.65 
 
 		 614 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.63 
 
 		 629 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.52 
 
 		 621 aa  299  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  36.7 
 
 		 651 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  34.02 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  35.13 
 
 		 589 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  50.45 
 
 		 624 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>