More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4898 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  76.71 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  63.38 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  66.93 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  66.14 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  66.14 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  64.89 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  63.78 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  65.35 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  64.57 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  63.78 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  61.24 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.7 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  61.24 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  61.83 
 
 		 132 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 134 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  59.69 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  58.62 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  61.42 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.69 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  58.91 
 
 		 132 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  57.81 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.65 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  58.65 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  56.15 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  59.84 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  61.72 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  58.27 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  58.27 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  59.06 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  55.04 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  60.16 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  54.68 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 129 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.59 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.59 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.59 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.59 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  58.59 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 239 aa  151  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  54.62 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  55.04 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  53.44 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0089  MerR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50.78 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 136 aa  133  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 135 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.09 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.09 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.09 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.09 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.09 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>