139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4815 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  100 
 
 		 434 aa  872    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  50.23 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  47.93 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  37.12 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  30.09 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  29.3 
 
 		 426 aa  156  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  31.19 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  31.19 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.57 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.57 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  30 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  25.72 
 
 		 529 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  26.33 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  39 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  22.45 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  24.12 
 
 		 816 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.61 
 
 		 234 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  36.04 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  36.04 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  41.67 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  24.66 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  36.46 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.13 
 
 		 191 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  22.82 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 219 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.29 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.34 
 
 		 189 aa  67  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  30.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.74 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  23 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  33.33 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  30.15 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 196 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.38 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.14 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.44 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.44 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.4 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  24.77 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.36 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  30.53 
 
 		 175 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  26.19 
 
 		 661 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 186 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 177 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.96 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.72 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 185 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 190 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.36 
 
 		 152 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.34 
 
 		 205 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  36.73 
 
 		 196 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  29.9 
 
 		 153 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  34.74 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.44 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 178 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.91 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 243 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.26 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  27.88 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 190 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.7 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 920 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  35.63 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>