More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4788 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  42.12 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 		 705 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  37.29 
 
 		 907 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8508  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.0306024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  36.23 
 
 		 884 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  32.46 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 679 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.16 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.63 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.74 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.88 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 683 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 703 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.24 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  28.83 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>