28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4758 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  47.25 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  33.81 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  31.22 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  34.72 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  30 
 
 		 271 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.25 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  32 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  31.79 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  31.07 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  36.5 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  39.23 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  30.5 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  36.52 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  30.39 
 
 		 265 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  32.06 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  36.94 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  36.87 
 
 		 317 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  34.57 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.08 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  26.26 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  26.26 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  28.71 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  27.67 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  30.57 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>