68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4518 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
485 aa  959  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  53.73 
 
 
478 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  52.97 
 
 
478 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  50 
 
 
454 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  47.36 
 
 
499 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.37 
 
 
481 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.48 
 
 
482 aa  275  1e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
523 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  35.29 
 
 
474 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  34.5 
 
 
462 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  31.69 
 
 
445 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  31.28 
 
 
442 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  31.88 
 
 
466 aa  203  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
455 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.98 
 
 
474 aa  197  4e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  33.05 
 
 
471 aa  197  4e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  32.19 
 
 
465 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  32.05 
 
 
469 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  31.62 
 
 
469 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  33.26 
 
 
470 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  33.76 
 
 
466 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.91 
 
 
460 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.91 
 
 
460 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  32.19 
 
 
467 aa  190  6e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.68 
 
 
460 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.54 
 
 
453 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.1 
 
 
475 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.47 
 
 
467 aa  184  4e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  31.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  31.72 
 
 
444 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.48 
 
 
468 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  33.48 
 
 
473 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 
445 aa  174  3e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  31.4 
 
 
473 aa  174  4e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  28.76 
 
 
455 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  29.74 
 
 
453 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  30.09 
 
 
456 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  28.6 
 
 
470 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  35.71 
 
 
1751 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.65 
 
 
443 aa  147  4e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  29.68 
 
 
464 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  28.09 
 
 
479 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 
883 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
480 aa  130  5e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.33 
 
 
466 aa  130  7e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.04 
 
 
455 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  24.95 
 
 
468 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  25.81 
 
 
468 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  26.48 
 
 
458 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.73 
 
 
506 aa  83.6  8e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28.48 
 
 
490 aa  70.9  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.39 
 
 
494 aa  70.9  6e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  70.5  7e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  70.5  7e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  29.61 
 
 
477 aa  62.4  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  23.55 
 
 
533 aa  58.9  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  27.81 
 
 
633 aa  57.4  6e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  29.2 
 
 
483 aa  52.4  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.81 
 
 
572 aa  52  2e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.81 
 
 
516 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.74 
 
 
608 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  26.18 
 
 
507 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>