207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4340 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  71.71 
 
 		 240 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  72.98 
 
 		 239 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  71.26 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  65.62 
 
 		 253 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3508  septum formation inhibitor  65.04 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0612972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  64.26 
 
 		 242 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1704  septum site-determining protein MinC  48.77 
 
 		 244 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1424  septum formation inhibitor  50.2 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3376  septum formation inhibitor  50.43 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1263  septum formation inhibitor  49.8 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.621353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0632  septum site-determining protein MinC  49.8 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  44.35 
 
 		 231 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1213  septum formation inhibitor  47.95 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0285  septum site-determining protein MinC  44.26 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  48.76 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2881  septum formation inhibitor  48.94 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5493  septum site-determining protein MinC  39.93 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3375  septum formation inhibitor  45.19 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.789938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  45.15 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1217  septum formation inhibitor  47.58 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3689  septum formation inhibitor  47.7 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000254308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1428  septum formation inhibitor  47.14 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1267  septum formation inhibitor  47.58 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.5381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  34.92 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  38.37 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  34.9 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  33.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  33.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  33.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  33.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  57.73 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  56 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  35.51 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  37.87 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  34.96 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  32.92 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  33.47 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  35.05 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  31.78 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  31.78 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  32.27 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  32.27 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  32.27 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  32.27 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  32.27 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  36.62 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  32.5 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  32.5 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  32.5 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  30.59 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  31.02 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  36.15 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  37.96 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  44.27 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  30.86 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  34.07 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  31.54 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  31.02 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  31.02 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  31.02 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  31.02 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  32.79 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  33.94 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  49.09 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  49.09 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  34.23 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  33.19 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  50.46 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  31.56 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  50.46 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  50.46 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  32.64 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  32.92 
 
 		 221 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  30.99 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  36.24 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  35.32 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  49.54 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  29.92 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  30.08 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  31.17 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  31.17 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  31.17 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  32.81 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  34.4 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  29.92 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  49.53 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  44.53 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  48.57 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  48.6 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  31.12 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  48.6 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>