12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4298 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4298  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  817    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4086  hypothetical protein  31.82 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2237  hypothetical protein  27.68 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02562  hypothetical protein  27.57 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1108  hypothetical protein  26.25 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.15681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  28.79 
 
 		 137 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  40.26 
 
 		 152 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  29.51 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  35.53 
 
 		 152 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  27.41 
 
 		 145 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  34.21 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  35.8 
 
 		 131 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>