More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4194 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73 
 
 		 1135 aa  771    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.55 
 
 		 1136 aa  787    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  64.2 
 
 		 704 aa  659    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 		 951 aa  1912    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  74.74 
 
 		 806 aa  736    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.33 
 
 		 807 aa  687    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.44 
 
 		 1094 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  75.8 
 
 		 854 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  59.26 
 
 		 821 aa  876    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  74.75 
 
 		 880 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  77.8 
 
 		 872 aa  814    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.69 
 
 		 894 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.99 
 
 		 1153 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.67 
 
 		 1091 aa  785    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.11 
 
 		 1134 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  67.39 
 
 		 954 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  75.8 
 
 		 874 aa  775    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  67.38 
 
 		 819 aa  858    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  71.26 
 
 		 833 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  78.04 
 
 		 845 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.49 
 
 		 781 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  69.44 
 
 		 1094 aa  703    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.1 
 
 		 871 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  71.54 
 
 		 995 aa  709    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.13 
 
 		 726 aa  675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  67.33 
 
 		 849 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.89 
 
 		 787 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.66 
 
 		 852 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.8 
 
 		 858 aa  775    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.9 
 
 		 825 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  61.86 
 
 		 793 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  63.98 
 
 		 963 aa  714    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.71 
 
 		 815 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.62 
 
 		 822 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  63.82 
 
 		 797 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.23 
 
 		 823 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.18 
 
 		 889 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.67 
 
 		 835 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  71.57 
 
 		 825 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.05 
 
 		 902 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  69.44 
 
 		 1091 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  64.42 
 
 		 1015 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.48 
 
 		 1221 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.9 
 
 		 881 aa  778    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.02 
 
 		 882 aa  985    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  76.6 
 
 		 840 aa  779    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.83 
 
 		 871 aa  779    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.69 
 
 		 888 aa  772    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.31 
 
 		 853 aa  743    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.75 
 
 		 826 aa  765    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  68.4 
 
 		 808 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.41 
 
 		 895 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.27 
 
 		 912 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.51 
 
 		 1040 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.85 
 
 		 809 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75 
 
 		 890 aa  764    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.34 
 
 		 872 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  60.04 
 
 		 848 aa  632  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.76 
 
 		 792 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  64.12 
 
 		 827 aa  627  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  59.04 
 
 		 809 aa  601  1e-170  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  50.78 
 
 		 1477 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.01 
 
 		 757 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.91 
 
 		 917 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  53.94 
 
 		 751 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  53.71 
 
 		 760 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  49.83 
 
 		 745 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.01 
 
 		 821 aa  515  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.98 
 
 		 786 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.94 
 
 		 1202 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.98 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3475  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.6 
 
 		 780 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  52.56 
 
 		 1299 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  50.18 
 
 		 778 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.8 
 
 		 866 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.76 
 
 		 789 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.47 
 
 		 1310 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  55.04 
 
 		 769 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  47.47 
 
 		 1310 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.25 
 
 		 716 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  50.18 
 
 		 778 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.98 
 
 		 774 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  53.08 
 
 		 1673 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  52.17 
 
 		 789 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.47 
 
 		 1157 aa  503  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  51.9 
 
 		 928 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  51.57 
 
 		 794 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  52.28 
 
 		 794 aa  502  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  53.16 
 
 		 769 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.09 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  53.51 
 
 		 776 aa  502  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.5 
 
 		 784 aa  502  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.26 
 
 		 837 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.1 
 
 		 837 aa  502  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.56 
 
 		 1329 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  55.81 
 
 		 776 aa  499  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  51.98 
 
 		 1834 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.92 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  53.56 
 
 		 1310 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  51.98 
 
 		 1851 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>